Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PgrQ00175 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PgrQ00175 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PgrQ00175 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PgrQ00175 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PgrQ00175 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PgrQ00175 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PgrQ00175 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PgrQ00175 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PgrQ00175 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PgrQ00175 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PgrQ00175 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PgrQ00175 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PgrQ00175 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PgrQ00175 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PgrQ00175 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PgrQ00175 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PgrQ00175 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PgrQ00175 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PgrQ00175 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PgrQ00175 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PgrQ00175 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PgrQ00175 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PgrQ00175 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PgrQ00175 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PgrQ00175 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PgrQ00175 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PgrQ00175 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PgrQ00175 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PgrQ00175 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PgrQ00175 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PgrQ00175 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PgrQ00175 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PgrQ00175 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PgrQ00175 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PgrQ00175 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PgrQ00175 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PgrQ00175 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PgrQ00175 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PgrQ00175 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PgrQ00175 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PgrQ00175 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PgrQ00175 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PgrQ00175 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PgrQ00175 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PgrQ00175 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PgrQ00175 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PgrQ00175 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms