Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cds1P98191 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cds1P98191 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cds1P98191 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cds1P98191 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cds1P98191 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cds1P98191 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cds1P98191 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cds1P98191 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cds1P98191 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cds1P98191 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cds1P98191 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cds1P98191 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cds1P98191 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cds1P98191 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cds1P98191 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms