Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2cP97760 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2cP97760 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2cP97760 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2cP97760 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2cP97760 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2cP97760 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2cP97760 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2cP97760 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2cP97760 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2cP97760 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2cP97760 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr2cP97760 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr2cP97760 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Polr2cP97760 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms