Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd1P97443 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smyd1P97443 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smyd1P97443 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smyd1P97443 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms