Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkx3-1P97436 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkx3-1P97436 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkx3-1P97436 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkx3-1P97436 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkx3-1P97436 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkx3-1P97436 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkx3-1P97436 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkx3-1P97436 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkx3-1P97436 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkx3-1P97436 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkx3-1P97436 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nkx3-1P97436 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx3-1P97436 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx3-1P97436 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx3-1P97436 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx3-1P97436 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx3-1P97436 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx3-1P97436 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx3-1P97436 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx3-1P97436 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx3-1P97436 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms