Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Nkx2-3P97334 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nkx2-3P97334 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nkx2-3P97334 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nkx2-3P97334 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms