Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptprn2P80560 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptprn2P80560 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms