Protein–RNA interactions for Protein: P70434

Irf7, Interferon regulatory factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf7P70434 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf7P70434 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf7P70434 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf7P70434 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf7P70434 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf7P70434 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf7P70434 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf7P70434 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf7P70434 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf7P70434 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irf7P70434 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf7P70434 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf7P70434 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf7P70434 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms