Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp7P70280 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp7P70280 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms