Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf6P70279 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf6P70279 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf6P70279 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Surf6P70279 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf6P70279 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf6P70279 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Surf6P70279 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Surf6P70279 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Surf6P70279 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf6P70279 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf6P70279 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf6P70279 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf6P70279 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf6P70279 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.3 ms