Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad54lP70270 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms