Protein–RNA interactions for Protein: P70213

Fv1, Friend virus susceptibility protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv1P70213 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fv1P70213 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv1P70213 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv1P70213 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv1P70213 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv1P70213 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv1P70213 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv1P70213 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fv1P70213 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fv1P70213 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fv1P70213 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fv1P70213 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fv1P70213 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fv1P70213 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fv1P70213 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fv1P70213 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fv1P70213 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv1P70213 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv1P70213 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fv1P70213 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv1P70213 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fv1P70213 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv1P70213 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv1P70213 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv1P70213 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms