Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plxna3P70208 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plxna3P70208 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plxna3P70208 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms