Protein–RNA interactions for Protein: P63328

Ppp3ca, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp3caP63328 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp3caP63328 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp3caP63328 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp3caP63328 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppp3caP63328 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppp3caP63328 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppp3caP63328 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppp3caP63328 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp3caP63328 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp3caP63328 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms