Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps17P63276 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps17P63276 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps17P63276 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps17P63276 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps17P63276 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps17P63276 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps17P63276 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps17P63276 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps17P63276 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps17P63276 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps17P63276 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps17P63276 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps17P63276 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps17P63276 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps17P63276 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps17P63276 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rps17P63276 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps17P63276 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps17P63276 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps17P63276 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps17P63276 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps17P63276 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps17P63276 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps17P63276 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps17P63276 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps17P63276 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps17P63276 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps17P63276 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps17P63276 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps17P63276 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps17P63276 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps17P63276 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps17P63276 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps17P63276 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps17P63276 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps17P63276 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps17P63276 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps17P63276 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps17P63276 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps17P63276 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps17P63276 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps17P63276 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps17P63276 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps17P63276 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps17P63276 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps17P63276 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps17P63276 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms