Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actg1P63260 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actg1P63260 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actg1P63260 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actg1P63260 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actg1P63260 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Actg1P63260 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Actg1P63260 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Actg1P63260 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actg1P63260 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actg1P63260 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actg1P63260 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actg1P63260 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actg1P63260 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Actg1P63260 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actg1P63260 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actg1P63260 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Actg1P63260 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actg1P63260 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actg1P63260 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms