Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp2P63044 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp2P63044 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms