Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vsnl1P62761 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vsnl1P62761 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms