Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab11aP62492 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11aP62492 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11aP62492 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11aP62492 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11aP62492 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11aP62492 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11aP62492 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms