Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnnP61807 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnnP61807 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnnP61807 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnnP61807 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnnP61807 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnnP61807 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnnP61807 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnnP61807 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnnP61807 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnnP61807 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnnP61807 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SnnP61807 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SnnP61807 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnnP61807 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnnP61807 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnnP61807 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnnP61807 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnnP61807 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SnnP61807 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnnP61807 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SnnP61807 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnnP61807 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnnP61807 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnnP61807 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnnP61807 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnnP61807 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SnnP61807 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnnP61807 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnnP61807 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnnP61807 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnnP61807 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnnP61807 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnnP61807 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnnP61807 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SnnP61807 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnnP61807 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnnP61807 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnnP61807 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnnP61807 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnnP61807 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnnP61807 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnnP61807 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnnP61807 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnnP61807 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnnP61807 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnnP61807 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnnP61807 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnnP61807 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnnP61807 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnnP61807 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnnP61807 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnnP61807 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnnP61807 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SnnP61807 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SnnP61807 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnnP61807 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnnP61807 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SnnP61807 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnnP61807 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnnP61807 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnnP61807 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnnP61807 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnnP61807 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnnP61807 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnnP61807 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnnP61807 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnnP61807 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnnP61807 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnnP61807 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnnP61807 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnnP61807 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SnnP61807 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnnP61807 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnnP61807 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnnP61807 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnnP61807 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnnP61807 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnnP61807 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SnnP61807 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnnP61807 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnnP61807 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnnP61807 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnnP61807 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnnP61807 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnnP61807 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnnP61807 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnnP61807 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnnP61807 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnnP61807 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SnnP61807 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnnP61807 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnnP61807 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnnP61807 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnnP61807 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnnP61807 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnnP61807 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SnnP61807 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnnP61807 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnnP61807 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms