Protein–RNA interactions for Protein: P61375

Lhx5, LIM/homeobox protein Lhx5, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx5P61375 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lhx5P61375 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lhx5P61375 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lhx5P61375 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lhx5P61375 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lhx5P61375 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lhx5P61375 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lhx5P61375 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx5P61375 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lhx5P61375 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx5P61375 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms