Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rims4P60191 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rims4P60191 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rims4P60191 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rims4P60191 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rims4P60191 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rims4P60191 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rims4P60191 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rims4P60191 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rims4P60191 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rims4P60191 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rims4P60191 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rims4P60191 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rims4P60191 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rims4P60191 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rims4P60191 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rims4P60191 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rims4P60191 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rims4P60191 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rims4P60191 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rims4P60191 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rims4P60191 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rims4P60191 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rims4P60191 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rims4P60191 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms