Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk2P58801 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ripk2P58801 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ripk2P58801 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ripk2P58801 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ripk2P58801 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ripk2P58801 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ripk2P58801 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ripk2P58801 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ripk2P58801 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ripk2P58801 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ripk2P58801 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ripk2P58801 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ripk2P58801 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms