Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tm6sf1P58749 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tm6sf1P58749 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tm6sf1P58749 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tm6sf1P58749 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms