Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Tlr8P58682 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Tlr8P58682 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tlr8P58682 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tlr8P58682 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tlr8P58682 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tlr8P58682 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tlr8P58682 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tlr8P58682 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tlr8P58682 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tlr8P58682 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tlr8P58682 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tlr8P58682 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tlr8P58682 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tlr8P58682 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tlr8P58682 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tlr8P58682 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Tlr8P58682 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tlr8P58682 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tlr8P58682 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tlr8P58682 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tlr8P58682 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Tlr8P58682 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tlr8P58682 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tlr8P58682 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tlr8P58682 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms