Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd4P58467 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd4P58467 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd4P58467 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setd4P58467 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Setd4P58467 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setd4P58467 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setd4P58467 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setd4P58467 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd4P58467 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setd4P58467 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setd4P58467 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd4P58467 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms