Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp25P57080 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp25P57080 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp25P57080 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp25P57080 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp25P57080 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp25P57080 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp25P57080 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp25P57080 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp25P57080 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp25P57080 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms