Protein–RNA interactions for Protein: P56655

Cyp2c38, Cytochrome P450 2C38, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c38P56655 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c38P56655 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c38P56655 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c38P56655 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c38P56655 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c38P56655 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c38P56655 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c38P56655 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c38P56655 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c38P56655 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c38P56655 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c38P56655 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp2c38P56655 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c38P56655 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp2c38P56655 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c38P56655 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c38P56655 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c38P56655 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c38P56655 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c38P56655 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c38P56655 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c38P56655 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c38P56655 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c38P56655 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c38P56655 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c38P56655 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms