Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TdgP56581 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TdgP56581 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TdgP56581 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TdgP56581 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TdgP56581 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TdgP56581 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TdgP56581 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TdgP56581 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TdgP56581 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TdgP56581 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TdgP56581 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TdgP56581 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TdgP56581 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TdgP56581 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TdgP56581 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TdgP56581 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TdgP56581 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TdgP56581 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TdgP56581 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TdgP56581 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TdgP56581 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TdgP56581 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TdgP56581 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TdgP56581 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TdgP56581 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TdgP56581 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TdgP56581 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TdgP56581 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TdgP56581 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TdgP56581 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TdgP56581 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TdgP56581 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TdgP56581 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TdgP56581 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TdgP56581 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TdgP56581 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TdgP56581 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TdgP56581 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TdgP56581 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TdgP56581 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TdgP56581 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TdgP56581 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TdgP56581 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TdgP56581 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TdgP56581 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TdgP56581 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TdgP56581 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TdgP56581 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TdgP56581 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TdgP56581 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TdgP56581 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TdgP56581 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TdgP56581 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TdgP56581 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TdgP56581 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TdgP56581 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TdgP56581 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TdgP56581 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TdgP56581 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TdgP56581 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TdgP56581 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TdgP56581 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TdgP56581 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TdgP56581 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TdgP56581 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TdgP56581 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TdgP56581 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TdgP56581 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TdgP56581 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TdgP56581 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TdgP56581 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TdgP56581 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TdgP56581 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TdgP56581 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TdgP56581 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TdgP56581 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TdgP56581 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TdgP56581 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TdgP56581 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TdgP56581 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TdgP56581 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TdgP56581 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TdgP56581 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TdgP56581 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TdgP56581 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TdgP56581 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TdgP56581 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TdgP56581 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TdgP56581 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TdgP56581 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TdgP56581 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TdgP56581 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TdgP56581 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TdgP56581 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TdgP56581 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TdgP56581 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TdgP56581 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TdgP56581 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TdgP56581 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms