Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctbp2P56546 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctbp2P56546 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctbp2P56546 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms