Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gp1bbP56400 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gp1bbP56400 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms