Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GferP56213 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GferP56213 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GferP56213 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GferP56213 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GferP56213 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GferP56213 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GferP56213 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GferP56213 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GferP56213 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GferP56213 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GferP56213 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GferP56213 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GferP56213 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GferP56213 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GferP56213 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GferP56213 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GferP56213 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GferP56213 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GferP56213 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GferP56213 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GferP56213 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GferP56213 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GferP56213 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GferP56213 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GferP56213 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GferP56213 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GferP56213 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GferP56213 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GferP56213 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GferP56213 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GferP56213 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GferP56213 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GferP56213 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GferP56213 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GferP56213 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GferP56213 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GferP56213 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GferP56213 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GferP56213 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GferP56213 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GferP56213 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GferP56213 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GferP56213 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GferP56213 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GferP56213 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GferP56213 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GferP56213 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GferP56213 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GferP56213 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GferP56213 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GferP56213 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GferP56213 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GferP56213 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GferP56213 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GferP56213 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GferP56213 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GferP56213 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GferP56213 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GferP56213 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GferP56213 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GferP56213 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GferP56213 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GferP56213 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GferP56213 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GferP56213 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GferP56213 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GferP56213 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GferP56213 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GferP56213 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GferP56213 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GferP56213 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GferP56213 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GferP56213 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GferP56213 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GferP56213 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GferP56213 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GferP56213 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GferP56213 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GferP56213 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GferP56213 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GferP56213 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GferP56213 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GferP56213 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GferP56213 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GferP56213 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GferP56213 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GferP56213 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GferP56213 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GferP56213 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GferP56213 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GferP56213 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GferP56213 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GferP56213 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GferP56213 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GferP56213 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GferP56213 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GferP56213 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GferP56213 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GferP56213 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms