Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex2P55098 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pex2P55098 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex2P55098 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex2P55098 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex2P55098 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex2P55098 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex2P55098 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex2P55098 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex2P55098 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex2P55098 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pex2P55098 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex2P55098 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pex2P55098 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex2P55098 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex2P55098 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pex2P55098 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pex2P55098 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pex2P55098 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pex2P55098 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pex2P55098 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pex2P55098 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pex2P55098 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pex2P55098 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pex2P55098 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pex2P55098 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms