Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ephb3P54754 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ephb3P54754 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ephb3P54754 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb3P54754 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms