Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab2aP53994 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab2aP53994 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms