Protein–RNA interactions for Protein: P53986

Slc16a1, Monocarboxylate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a1P53986 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc16a1P53986 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc16a1P53986 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms