Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtbP53612 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtbP53612 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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