Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp10P52479 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp10P52479 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp10P52479 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp10P52479 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp10P52479 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp10P52479 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp10P52479 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp10P52479 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp10P52479 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp10P52479 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp10P52479 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp10P52479 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp10P52479 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp10P52479 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp10P52479 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp10P52479 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms