Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aff3P51827 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff3P51827 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff3P51827 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff3P51827 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Aff3P51827 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aff3P51827 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aff3P51827 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aff3P51827 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aff3P51827 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aff3P51827 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aff3P51827 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aff3P51827 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff3P51827 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff3P51827 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff3P51827 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff3P51827 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff3P51827 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff3P51827 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff3P51827 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff3P51827 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms