Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SftpbP50405 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpbP50405 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpbP50405 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SftpbP50405 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SftpbP50405 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SftpbP50405 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpbP50405 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpbP50405 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpbP50405 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpbP50405 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SftpbP50405 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SftpbP50405 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SftpbP50405 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SftpbP50405 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SftpbP50405 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms