Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SftpdP50404 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SftpdP50404 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SftpdP50404 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SftpdP50404 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SftpdP50404 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SftpdP50404 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SftpdP50404 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SftpdP50404 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SftpdP50404 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SftpdP50404 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SftpdP50404 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SftpdP50404 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SftpdP50404 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms