Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CtshP49935 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CtshP49935 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CtshP49935 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CtshP49935 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CtshP49935 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtshP49935 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtshP49935 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtshP49935 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CtshP49935 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtshP49935 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtshP49935 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtshP49935 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtshP49935 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtshP49935 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtshP49935 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CtshP49935 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CtshP49935 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CtshP49935 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CtshP49935 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CtshP49935 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CtshP49935 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CtshP49935 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CtshP49935 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CtshP49935 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtshP49935 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtshP49935 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CtshP49935 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtshP49935 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtshP49935 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CtshP49935 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CtshP49935 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CtshP49935 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CtshP49935 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CtshP49935 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CtshP49935 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtshP49935 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtshP49935 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtshP49935 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtshP49935 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtshP49935 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtshP49935 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CtshP49935 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtshP49935 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtshP49935 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtshP49935 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtshP49935 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtshP49935 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtshP49935 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtshP49935 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtshP49935 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtshP49935 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CtshP49935 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtshP49935 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtshP49935 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtshP49935 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtshP49935 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtshP49935 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtshP49935 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtshP49935 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtshP49935 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtshP49935 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtshP49935 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtshP49935 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtshP49935 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CtshP49935 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CtshP49935 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CtshP49935 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CtshP49935 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CtshP49935 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CtshP49935 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CtshP49935 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CtshP49935 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CtshP49935 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CtshP49935 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CtshP49935 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CtshP49935 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CtshP49935 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CtshP49935 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CtshP49935 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CtshP49935 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CtshP49935 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CtshP49935 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CtshP49935 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CtshP49935 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CtshP49935 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CtshP49935 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CtshP49935 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CtshP49935 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtshP49935 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtshP49935 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtshP49935 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtshP49935 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtshP49935 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtshP49935 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtshP49935 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtshP49935 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CtshP49935 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CtshP49935 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CtshP49935 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms