Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbp3P49194 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbp3P49194 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbp3P49194 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbp3P49194 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1154.1 ms