Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni3P48787 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnni3P48787 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms