Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Resp18P47939 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Resp18P47939 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Resp18P47939 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Resp18P47939 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Resp18P47939 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Resp18P47939 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Resp18P47939 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Resp18P47939 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Resp18P47939 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Resp18P47939 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Resp18P47939 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Resp18P47939 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Resp18P47939 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Resp18P47939 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Resp18P47939 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Resp18P47939 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Resp18P47939 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Resp18P47939 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Resp18P47939 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms