Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SrprbP47758 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SrprbP47758 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SrprbP47758 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SrprbP47758 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SrprbP47758 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SrprbP47758 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SrprbP47758 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrprbP47758 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrprbP47758 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SrprbP47758 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SrprbP47758 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrprbP47758 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrprbP47758 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms