Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11bP46638 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11bP46638 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11bP46638 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11bP46638 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11bP46638 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms