Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lig1P37913 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lig1P37913 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lig1P37913 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lig1P37913 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lig1P37913 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lig1P37913 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lig1P37913 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lig1P37913 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lig1P37913 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lig1P37913 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lig1P37913 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lig1P37913 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lig1P37913 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms