Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sar1aP36536 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sar1aP36536 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sar1aP36536 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sar1aP36536 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sar1aP36536 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sar1aP36536 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sar1aP36536 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sar1aP36536 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sar1aP36536 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sar1aP36536 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1aP36536 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1aP36536 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms