Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Grin2aP35436 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Grin2aP35436 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Grin2aP35436 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Grin2aP35436 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Grin2aP35436 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Grin2aP35436 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Grin2aP35436 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Grin2aP35436 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Grin2aP35436 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Grin2aP35436 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Grin2aP35436 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms